建设成果
-
广州健康院合作揭示小鼠胚胎生长发育的时间变化规律2026年6月1日，中国科学院广州生物医药与健康研究院（以下简称“广州健康院”）细胞命运研究组、时空谱系技术创新与应用研究组，联合西湖大学与广州国家实验室团队，在Nature Cell Biology期刊在线发表题为“Developmental chronology of mouse embryo from 2-cell stage through birth”的研究论文。该研究建立了包含220个单细胞的转录组学图谱，完整记录了小鼠胚胎从二细胞到出生共计37个时间点的发育过程，是目前世界上时间线最完整的小鼠胚胎发育参考图谱。生命如何从一枚受精卵，生长为结构完整的个体，一直是生命科学领域的重要...查看详情022026-06 -
广州健康院开发可解释AI模型精准鉴定细胞谱系特征基因近日，中国科学院广州生物医药与健康研究院（以下简称“广州健康院”） 细胞数字孪生研究组在《Briefings in Bioinformatics》上发表了题为“scMarkerGene: an interpretable neural network framework for cell-type-specific marker gene discovery”的研究论文。细胞类型的精准识别是单细胞转录组学分析的基础，而细胞类型特异性标记基因（marker gene）的发现则是这一过程的核心。传统方法多依赖统计阈值或聚类启发式策略，易受数据噪声、注释偏差及基因高表达但非特异性等问题的干扰。针对上述挑战，研究团队提出了scMarkerGene...查看详情282026-05 -
广州健康院合作建立血管内皮细胞胚胎发育谱系2月17日，中国科学院广州生物医药与健康研究院、华南理工大学、广州国家实验室和西湖大学联合团队在 Cell 发表题为 A single-cell time-series atlas of endothelial cell embryonic development 的研究论文。通过构建小鼠内皮细胞胚胎发育全程的谱系图（http://sted-ec.ccla.ac.cn/），发现血管内皮细胞在小鼠胚胎发育的孕中期，开始分化并逐步建立适配各个器官的内皮细胞。肺血管内皮富集基因Casz1影响肺血管生长、器官特异性分化和肺部的内皮-上皮的细胞互作。血管贯穿脊椎动物身体的每一个角落，不仅是血液运输的通道，还在器...查看详情262026-02 -
广州健康院提出高精度单细胞与空间组学整合算法Polyomino2025年10月22日，Genome Research在线发表中国科学院广州生物医药与健康研究院细胞命运研究组的研究论文，题为“Polyomino reconstructs spatial transcriptomic profiles with single-cell resolution via region-allocation method”，该论文被选为Genome Research第11期的封面文章。研究提出了一种全新的空间数据整合算法 Polyomino，能够在单细胞分辨率下高效、精准地重建空间转录组图谱。在生命体中，细胞并非孤立存在，它们需要根据空间位置相互通信，形成精密的组织与器官。空间转录组学作为揭示这一细胞蓝图的关键技术，近年...查看详情102025-11 -
广州健康院联合发布单细胞多组学新方法，实现胰腺癌循环肿瘤细胞多维度解析近日，中国科学院广州生物医药与健康研究院谱系基因组多维技术研究组林达研究员在Nature Communications期刊发表研究成果，报道了新开发的单细胞多组学技术-Uniform Chromosome Conformation Capture（Uni-C）。该方法可在一个细胞中同时解析基因组大尺度结构变异（如SV、CNV、ecDNA）、小尺度突变（SNP/INDEL）以及染色质三维构象，实现高分辨率、多维度的联合分析（图1）。 近日，中国科学院广州生物医药与健康研究院谱系基因组多维技术研究组林达研究员在Nature Communications期刊发表研究成果，报道了新开发的单细胞多组学技术-Uniform Chromosome Conformation Capture（Uni-C）。该方法可在一个细胞中同时解析基因组大尺度结构变异（如SV、CNV、ecDNA）、小尺度突变（SNP/INDEL）以及染色质三维构象，实现高分辨率、多维度的联合分析（图1）。胰腺癌异质性强、进展迅速，临床面临早筛困难、治疗靶点匮乏等挑战。循环肿瘤细胞（CTCs）因携带原发瘤的完整基因组信息，被视为无创检测和动态监测的重要窗口...查看详情302025-07 -
广州健康院合作开发CMAP算法，实现高精度单细胞空间定位2025年7月15日，中国科学院广州生物医药与健康研究院彭广敦课题组和广州国家实验室索生宝课题组合作，在Nature Communications上发表了题为High-resolution mapping of single cells in spatial context的研究论文。 2025年7月15日，中国科学院广州生物医药与健康研究院彭广敦课题组和广州国家实验室索生宝课题组合作，在Nature Communications上发表了题为High-resolution mapping of single cells in spatial context的研究论文。细胞是生命的基本结构和功能单元，其活动不仅受胞内基因网络调控，还受到胞外微环境和细胞间通讯的影响。单细胞转录组测序技术为解析细胞异质性带来了革命性突破，但这一技术在细胞捕获过程中丢失了空间位置信息，严重限制了我们对细胞命运决定和调控机制的深入理解。近年来，空间转录组技术迅速发展，成为揭示组织微环...查看详情232025-07
